Wyposażenie UCBO

Infrastruktura

Infrastruktura Centrum Badań Omicznych (CBO) pozwala na kompleksowe wykonywanie analiz z zakresu metabolomiki/lipidomiki, proteomiki/peptydomiki, transkryptomiki oraz genomiki.
Wyposażenie obejmuje najnowszą aparaturę naukową, między innymi:
LC/MS/MS (potrójny kwadrupol)

LC/MS/MS (potrójny kwadrupol) - służący do analiz ilościowych metabolomicznych, lipidomicznych, peptydomicznych

▪ Waters Xevo TQ Absolute UPLC/MS/MS

LC/MS/MS - wysoko rozdzielcze spektrometry mas do analizy jakościowej

LC/MS/MS - wysoko rozdzielcze spektrometry mas do analizy jakościowej typu kwadrupol-analizator czasu przelotu

▪ Waters CYCLIC IMS nUPLC/UPLC/MS/MS wysoko rozdzielczy spektrometr mas wyposażony w cykliczny moduł do spektrometrii ruchliwości jonów IMS (Ion mobility spectrometry) - proteomika, proteomika strukturalna, modyfikacje potranslacyjne białek, peptydomika,
▪ Waters SYNAPT XS nUPLC/UPLC/MS/MS wysoko rozdzielczy spektrometr mas wyposażony w moduł do spektrometrii ruchliwości jonów IMS (Ion mobility spectrometry) - metabolomika, lipidomika, peptydomika, proteomika, mapowanie tkanek techniką DESI
▪ Waters Xevo G2 nUPLC /UPLC/MS/MS - metabolomika, lipidomika, peptydomika

GC/MS/MS (potrójny kwadrupol)
▪ Waters Xevo TQ-GC GC-MS/MS - służy do analizy ilościowej związków lotnych, nastrzyk ciekły jak również analiza związków o bardzo niskiej temperaturze wrzenia z wykorzystaniem dozownika typu headspace
Urządzenia do sekwencjonowania genomu
▪ Illumina NextSeq 2000 Sequencing System - wysokoprzepustowy sekwenator umożliwia wykonanie szerokiego zakresu aplikacji NGS, w tym sekwencjonowania eksomów oraz transkryptomów w pojedynczej reakcji
▪ Illumina MiSeq System - sekwenator o niższej przepustowości, przeznaczony do sekwencjonowania głównie paneli genowych
System do multipleksowej analizy biomolekuł
▪ Bio-Plex 200 System do multipleksowej analizy biomolekuł w technologii zawiesiny macierzy z automatyczną płuczką magnetyczno-próżniową. Umożliwia analizę ilościową białek i kwasów nukleinowych
Automatyczny syntezator mikrofalowy peptydów
▪ Biotage Initiator+ Alstra - Microwave Peptide Synthesizer- możliwość syntezy peptydów/ minibiałek/ podjednostek białek do 60-70 reszt aminokwasowych
Ponadto Centrum posiada liczne urządzenia pomocnicze między innymi: aparat RT PCR CFX96 Bio-Rad, zestaw do liofilizacji ,Labconco, FreeZone, z 12 portową stalową komorą suszącą; koncentrator próżniowy Heto; Hetovac VR-1, z systemem chłodzącym; manifold do µSPE ( ang. mikro Solid Phase Extraction) na płytki 96 dołkowe firmy Waters; wirówkę Eppendorf Centrifuge 5430 R, wytrząsarkę rotacyjną Eppendorf ThermoMixer C.